La bibliothèque Menéndez Pelayo est située dans un bâtiment conçu par Leonardo Rucabado pour abriter les collections bibliographiques personnelles que le polygraphe Marcelino Menéndez Pelayo a léguées à la ville de Santander après sa mort en 1912, lorsque la collection a été fermée.
La bibliothèque contient l'une des collections patrimoniales les plus importantes d'Espagne, en raison de la rareté et de l'unicité de ses ouvrages, avec environ 45 000 volumes imprimés et manuscrits du XIVe au début du XXe siècle. Parmi ses ouvrages d'une grande valeur historique et patrimoniale, on trouve des incunables, des codex médiévaux ou des manuscrits de Quevedo, Lope de Vega, Calderón de la Barca, ainsi que les œuvres et les lettres de Menéndez Pelayo.
À l'entrée de la façade principale de la bibliothèque, inaugurée par Alfonso XIII le 23 août 1923, se trouve une statue assise de Marcelino Menéndez Pelayo, réalisée en marbre de Carrare par Mariano Benlliure, tandis qu'à l'entrée arrière se trouve le jardin de son frère Enrique, qui donne accès à ce qui fut la maison de la famille Menéndez Pelayo. Le bâtiment abrite actuellement la Maison-Musée, où l'on peut voir la salle à manger, le salon, le bureau d'Enrique Menéndez Pelayo et la chambre dans laquelle mourut Don Marcelino, ainsi que le siège de la Fondation Gerardo Diego.
La bibliothèque est actuellement fermée pour cause de rénovation des locaux.